Обслуживание научных кадров Западной Сибири началось в 1944 г. созданием библиотеки Западно-Сибирского филиала Академии наук СССР (ЗСФАН). В 1956 г. в целях расширения зоны обслуживания этой библиотеки на Урал, Восточную Сибирь и Дальний Восток Президиум АН СССР издал постановление «Об организации Восточного отделения Библиотеки Академии наук» (ВОБАН) в Новосибирске. ВОБАН базировалось на фондах библиотеки ЗСФАН, докомплектовалось фондами библиотеки Академии наук СССР (БАН), стало получать обязательный экземпляр. Но в мае 1957 г. было создано Сибирское отделение АН СССР.

В этой ситуации необходимо было приспособить складывающуюся систему библиотечного обслуживания к нуждам развивающейся науки. Постановлением Президиума СО АН СССР (1957) организация библиотечного и библиографического обслуживания учреждений СО АН СССР возлагалась на ВОБАН. Президиум АН СССР считал целесообразным в первые годы существования Сибирского отделения сохранить общее руководство ВОБАН и библиотеками сети за Библиотекой Академии наук СССР (БАН). Но различные источники финансирования и разрыв между подчиненностью ВОБАН и библиотек НИИ не способствовали преобразованию ВОБАН в центральную библиотеку Сибирского отделения. Да и само Отделение БАН было не готово выполнять эти функции.

Ведущие ученые Сибирского отделения писали в Москву, что ВОБАН не сможет выполнить своей задачи, если в него сразу целиком не влить фонды одной из крупнейших библиотек страны. Все эти факторы и явились объективной причиной появления новой крупной библиотеки - Государственной публичной научно-технической библиотеки (ГПНТБ) СО АН СССР.

Два года в Новосибирске формально имелись две центральные академические библиотеки: ГПНТБ СО АН СССР и ВОБАН. Затем последнее было преобразовано в Отделение ГПНТБ СО АН СССР (Распоряжение Президиума АН СССР N 815 от 19 августа 1962 г.). Решением Президиума АН СССР N 58-547 от 26 марта 1964 г. Новосибирское отделение ГПНТБ было передано в Академгородок в качестве центральной библиотеки. На открытие этой библиотеки для обслуживания читателей давался год. Реально библиотека открыла свои двери в 1966 г. Поэтому отмечая ЮБИЛЕЙ Отделения, мы руководствуемся двумя датами: 1956 год - создание ВОБАН и 1966 год - начало обслуживания читателей. Таким образом, 60 и 50 лет - два юбилея центральной библиотеки Новосибирского Академгородка.