Действительный член РАН (2013), действительный член PАМН (1997), член-корреспондент РАМН (1991), доктор медицинских наук (1982), профессор. Эмбриолог.

Научные исследования С. И. Колесникова в основном посвящены функционированию системы «мать — внезародышевые органы — плод» в зависимости от факторов внешней среды, состоянию регулятоpных систем и течению беременности.

Окончил Новосибирский государственный медицинский институт (1972). Младший научный сотрудник, руководитель лаборатории, ученый секретарь, заместитель директора Института клинической и экспериментальной медицины Сибирского отделения АМН СССР (1972–1987).

В 1987–2014 гг. — председатель Президиума Восточно-Сибирского филиала Сибирского отделения АМН СССР (затем до 2012 г. — Восточно-Сибирский НЦ СО РАМН) в Иркутске. Директор Научного центра медицинской экологии ВСНЦ СО РАМН (1998–2011). Советник Президиума РАМН (2001–2012), советник РАН (с 2013), заместитель главного ученого секретаря РАН (с 2018).

Автор более 400 научных трудов, ряда авторских свидетельств и патентов на изобретения.

Имеет государственные награды. Заслуженный деятель науки РФ (2002). Лауреат Премии Правительства РФ в области науки и техники (2008). Лауреат премии имени Н.И.Пирогова (2001).