Начиная с 1995 г. в Сибирском отделении РАН раз в два года проводится конкурс на премию им. Г. И. Будкера за работы в области ядерной физики, термоядерного синтеза и физики плазмы. В нем участвуют молодые физики в возрасте до 35 лет.

1995 г. — Аникеев Андрей Витальевич, Карпушов Александр Николаевич (ИЯФ) за работу «Исследование устойчивости и нагрева плазмы в газодинамической ловушке при инжекции мощных атомарных пучков».

1999 г. — Логашенко Иван Борисович (ИЯФ) за работу «Измерение адронных сечений с детектором КМД-2».

2002 г. — к.ф.-м.н. Мурахтин Сергей Викторович (ИЯФ) за цикл работ «Удержание термоядерной плазмы на установке ГДЛ».

2005 г. — м.н.с. Тодышев Корнелий Юрьевич (ИЯФ) за работу «Прецизионное измерение масс пси-мезонов».

2008 г. — Суляев Юлий Сергеевич (ИЯФ) за работу «Осцилляции нейтронной эмиссии горячей дейтериевой плазмы в многопробочной ловушке».

2011 г. — к.ф.-м.н. Пиминов Павел Алексеевич (ИЯФ) за работу «Оптимизация динамической апертуры электрон-позитронного суперколлайдера "Чарм-Тау фабрика" в Новосибирске».